Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rpap1Q80TE0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rpap1Q80TE0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rpap1Q80TE0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpap1Q80TE0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms