Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN7

Igsf5, Immunoglobulin superfamily member 5, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf5Q7TSN7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igsf5Q7TSN7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igsf5Q7TSN7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms