Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms