Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccp110Q7TSH4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccp110Q7TSH4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms