Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dsg1bQ7TSF1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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