Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrc2bQ7TPM1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms