Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp397Q7TNK4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms