Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shq1Q7TMX5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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