Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SynmQ70IV5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SynmQ70IV5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms