Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sned1Q70E20 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sned1Q70E20 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms