Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms