Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Efr3bQ6ZQ18 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efr3bQ6ZQ18 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efr3bQ6ZQ18 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Efr3bQ6ZQ18 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efr3bQ6ZQ18 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efr3bQ6ZQ18 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Efr3bQ6ZQ18 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efr3bQ6ZQ18 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Efr3bQ6ZQ18 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Efr3bQ6ZQ18 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efr3bQ6ZQ18 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efr3bQ6ZQ18 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efr3bQ6ZQ18 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efr3bQ6ZQ18 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Efr3bQ6ZQ18 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Efr3bQ6ZQ18 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Efr3bQ6ZQ18 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Efr3bQ6ZQ18 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efr3bQ6ZQ18 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Efr3bQ6ZQ18 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efr3bQ6ZQ18 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Efr3bQ6ZQ18 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Efr3bQ6ZQ18 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Efr3bQ6ZQ18 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Efr3bQ6ZQ18 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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