Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms