Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms