Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ift172Q6VH22 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ift172Q6VH22 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms