Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms