Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT7

Ccsmst1, Protein CCSMST1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsmst1Q6RUT7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccsmst1Q6RUT7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccsmst1Q6RUT7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccsmst1Q6RUT7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccsmst1Q6RUT7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccsmst1Q6RUT7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccsmst1Q6RUT7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccsmst1Q6RUT7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccsmst1Q6RUT7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccsmst1Q6RUT7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccsmst1Q6RUT7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms