Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp2b4Q6Q477 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b4Q6Q477 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b4Q6Q477 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms