Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudcd1Q6PIP5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms