Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc82Q6PG04 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms