Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pik3c3Q6PF93 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pik3c3Q6PF93 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pik3c3Q6PF93 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pik3c3Q6PF93 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pik3c3Q6PF93 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pik3c3Q6PF93 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pik3c3Q6PF93 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pik3c3Q6PF93 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pik3c3Q6PF93 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pik3c3Q6PF93 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pik3c3Q6PF93 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3c3Q6PF93 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms