Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SvoplQ6PDF3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SvoplQ6PDF3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms