Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms