Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trak1Q6PD31 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms