Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh2Q6P6J4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh2Q6P6J4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh2Q6P6J4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh2Q6P6J4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh2Q6P6J4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh2Q6P6J4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh2Q6P6J4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh2Q6P6J4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms