Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc148Q6P5U8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms