Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Podnl1Q6P3Y9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms