Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PrimpolQ6P1E7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms