Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf9bQ6NZA9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf9bQ6NZA9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms