Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gpbp1Q6NXH3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1Q6NXH3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms