Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Colgalt2Q6NVG7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms