Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SphkapQ6NSW3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SphkapQ6NSW3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms