Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pdcd11Q6NS46 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdcd11Q6NS46 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms