Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms