Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn11Q6J756 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms