Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms