Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt39Q6IFX4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt39Q6IFX4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms