Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6GQU0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6GQU0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6GQU0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6GQU0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6GQU0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6GQU0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6GQU0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6GQU0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6GQU0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms