Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx11Q6AXC6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx11Q6AXC6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ddx11Q6AXC6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx11Q6AXC6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx11Q6AXC6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms