Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rftn1Q6A0D4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms