Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn2Q68FG2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sptbn2Q68FG2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms