Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CilpQ66K08 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms