Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Top2bQ64511 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2bQ64511 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms