Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf1Q64213 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms