Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim24Q64127 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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