Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Zfp248Q640N4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Zfp248Q640N4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Zfp248Q640N4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Zfp248Q640N4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfp248Q640N4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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