Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aebp1Q640N1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Aebp1Q640N1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms