Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Znf260Q62513 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Znf260Q62513 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Znf260Q62513 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Znf260Q62513 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Znf260Q62513 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf260Q62513 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf260Q62513 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Znf260Q62513 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms