Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn4Q62472 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn4Q62472 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms