Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga3Q62470 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms